PubMed

PubMed é um recurso gratuito que é desenvolvido e mantido pelo Centro Nacional de Informações sobre Biotecnologia (NCBI), na Biblioteca Nacional de Medicina dos EUA (NLM), localizado no National Institutes of Health (NIH). O PubMed compreende mais de 24 milhões de citações na literatura biomédica (MEDLINE), revistas de ciências da vida, e livros on-line. 

 As citações PubMed e resumos incluem os campos da biomedicina e da saúde, abrangendo porções de ciências da vida, ciências do comportamento, ciências químicas e bioengenharia. O PubMed também permite o acesso a sites relevantes e links para outros recursos de biologia molecular do NCBI. (1)

Habilidades requeridas quanto ao uso do PubMed:

Para a execução das terefas propostas neste curso utilizamos várias funções disponiveis na máquina de pesquisa do PubMed por isso realizaremos um treinamento/revisão nos seguintes tópicos:
  • cadastro
  • sintaxe
  • download
  • MeSH database
  • histórico de buscas
  • anatomia dos resultados
  • tradução automática
  • atualizaçao automática da busca

A Sintaxe do PubMed

A sintaxe é o conjunto de convenções (linguagem) utilizado para se comunicar com a máquina de busca do PubMed. Podemos dividir os recursos de sintaxe em 3 três grupos:
  • Operadores Booleanos
  • Etiquetas de Campo
  • Recursos Acessórios


Os operadores booleanos (AND, OR, NOT) são utilizados para combinar termos de pesquisa.

  • AND recupera os resultados que incluem todos os termos de busca. 
  • OR recupera resultados que incluem pelo menos um dos termos de pesquisa. 
  • NOT exclui a recuperação de termos de sua pesquisa.



Exemplos:


 Encontrar as publicações da UFAL no ano de 2013:

Encontrar citações sobre os efeitos do calor ou umidade sobre a esclerose múltipla:


Encontrar citações sobre artrite mas excluíndo as revisões:

arthritis NOT review[pt]

Tradução automática de busca:

As etiquetas de campo são fundamentais para a busca no PubMed. quando o usuário não as explicita a busca é sumetida a uma "tradução automática" e as etiquetas são introduzida segundo um algoritmo.

Exemplo:
busca --> tradução automática
cancer -->   "neoplasms"[MeSH Terms] OR "neoplasms"[All Fields] OR "cancer"[All Fields]
arthritis -->  "arthritis"[MeSH Terms] OR "arthritis"[All Fields]
multiple sclerosis --> "multiple sclerosis"[MeSH Terms] OR ("multiple"[All Fields] AND "sclerosis"[All Fields]) OR "multiple sclerosis"[All Fields]

Etiquetas de Campo (Field Tags)

 Anatomia dos resultados (formato sumário)

Termos MeSH 

MeSH é uma enciclopédia de termos da Biblioteca Nacional Medicina. É constituída por conjuntos de termos de descritores em uma estrutura hierárquica, que permite buscas em vários níveis de especificidade.

 Os descritores MeSH  são dispostos tanto em ordem alfabética como em uma estrutura hierárquica. No nível mais geral da estrutura hierárquica estão grandes tópicos, como "Anatomia" ou "Transtornos Mentais". Posições mais específicas são encontrados em níveis mais estreitos dessa hierarquia composta por doze níveis, tais como "tornozelo" e "Transtorno da Conduta."

 Há 27.149 descritores MeSH (2014). Há também mais de 218.000 "termos de entrada" (entry terms) que remetem a termos MeSH mais adequados, por exemplo: "Vitamina C" é um termo de entrada para "ácido ascórbico." 

 Além desses títulos, existem mais de 219 mil títulos chamados registros de conceitos suplementares (anteriormente Supplementary Chemical Records) dentro de uma outra enciclopedia separada.


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